Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel3A2AHA7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms