Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ambra1A2AH22 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ambra1A2AH22 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms