Protein–RNA interactions for Protein: A2AGW7

Gm13089, Predicted gene 13089, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13089A2AGW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm13089A2AGW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm13089A2AGW7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm13089A2AGW7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm13089A2AGW7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm13089A2AGW7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms