Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2aA2A9G7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisal2aA2A9G7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal2aA2A9G7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms