Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87977A2A958 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87977A2A958 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87977A2A958 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms