Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm16A2A935 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms