Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc1lA2A5N3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms