Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm6268A2A3U9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6268A2A3U9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms