Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm3880A0A1B0GSB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3880A0A1B0GSB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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