Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RNP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RNP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms