Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhoaQ9QUI0 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms