Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms