Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q8BGC1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q8BGC1 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Loxhd1-201ENSMUST00000035501 3814 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms