Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms