Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Etfbkmt-204ENSMUST00000111551 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Mfap5-202ENSMUST00000118626 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 2310034C09Rik-201ENSMUST00000089111 946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm15749-201ENSMUST00000161848 612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Olfr122-201ENSMUST00000119082 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm12726-201ENSMUST00000121621 601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm17084-201ENSMUST00000163843 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms