Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CartptP56388 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CartptP56388 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms