Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atf6F6VAN0 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atf6F6VAN0 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atf6F6VAN0 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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