Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43499-201ENSMUST00000202091 2107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm21370-201ENSMUST00000177659 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8079-201ENSMUST00000182695 975 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1810007D17Rik-201ENSMUST00000187629 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 4933400L20Rik-202ENSMUST00000211119 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ly6g5b-201ENSMUST00000062657 1046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rad54b-201ENSMUST00000070755 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Taar3-201ENSMUST00000045152 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Celf2-213ENSMUST00000150624 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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