Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms