Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms