Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Fam50a-201ENSMUST00000114160 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 D330050G23Rik-202ENSMUST00000128305 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Polr1e-204ENSMUST00000133157 2986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Abcc12-205ENSMUST00000152438 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Pycard-201ENSMUST00000033056 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ywhae-201ENSMUST00000067664 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Slc12a4-202ENSMUST00000116429 3755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Zfp112-202ENSMUST00000120006 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm8326-201ENSMUST00000188705 1953 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Tkt-201ENSMUST00000022529 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Zfp42-203ENSMUST00000211248 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Tspan6-201ENSMUST00000087557 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm10790-202ENSMUST00000221285 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm19026-201ENSMUST00000194240 4530 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 AC120425.1-201ENSMUST00000225213 2360 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm15041-201ENSMUST00000119048 756 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irx2P81066 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms