Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
StomP54116 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
StomP54116 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
StomP54116 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
StomP54116 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
StomP54116 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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