Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Atrip-205ENSMUST00000161521 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms