Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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