Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbed5B2RPU8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms