Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gpcpd1-201ENSMUST00000028822 3179 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-204ENSMUST00000108607 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm3466-201ENSMUST00000181797 1192 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm46188-201ENSMUST00000219927 462 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25973-201ENSMUST00000083717 127 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12364-201ENSMUST00000144419 547 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm27500-201ENSMUST00000184331 336 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC140244.1-201ENSMUST00000228454 229 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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