Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp16Q99LG0 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp16Q99LG0 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp16Q99LG0 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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