Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc63Q8CDV6 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc63Q8CDV6 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms