Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Creb5-201ENSMUST00000047450 2330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Kcnf1Q7TSH7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm7208-202ENSMUST00000212442 1627 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Olfr320-202ENSMUST00000214662 3029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Lrrcc1-201ENSMUST00000091325 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnf1Q7TSH7 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms