Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Dsg1bQ7TSF1 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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