Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.33□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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