Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms