Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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