Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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