Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC154706.1-201ENSMUST00000225482 585 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11888-201ENSMUST00000120471 810 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Hmbox1-209ENSMUST00000176832 1586 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44992-210ENSMUST00000210126 1330 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45126-201ENSMUST00000206702 960 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 AC165159.1-201ENSMUST00000223825 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 1700029F12Rik-201ENSMUST00000091377 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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