Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms