Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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