Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms