Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms