Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms