Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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