Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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