Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Krt23Q99PS0 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt23Q99PS0 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1042.3 ms