Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tsnaxip1Q99P25 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tsnaxip1Q99P25 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms