Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atg16l1Q8C0J2 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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