Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp19Q3UJD6 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp19Q3UJD6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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