Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms