Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sox8Q04886 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms