Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms