Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ggta1P23336 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms